Sayyidi Syeikh telah menimba ilmu dari banyak para Masyayikh (Guru Besar) pada masa tersebut, seperti :
- Habib Sholih Bin Abdullah Al–‘Athos sebagaimana disebutkan di awal,
- Habib Abdullah Ash–Shodiq Al–Habsyi yang merupakan guru pertama beliau di Jeddah dan kepadanyalah beliau mempelajari Kitab Safinatun Najaa, Kifayatul Akhyar dan Al–Kawakib Ad–Durriyah serta menghadiri pengajian Kitab Al–Idhoh karya Imam An–Nawawi yang diadakan Sang Habib di masjid beliau,
- Syeikh Karomah Suhail, beliau mempelajari Kitab Safinatun Najaa beserta Syarahnya yaitu Nailur Rojaa sebanyak tiga kali. Ketika itu Syeikh Karomah berkata kepada beliau : “Kami membacakanmu kitab–kitab ini (Safinah & Nailur Rojaa) tapi kami akan memberikan penjelasan dari Syarah–Syarah Kitab Minhaj Ath–Tholibin”. Setelah itu beliau mempelajari bagian awal Kitab Minhaj kemudian Kitab Umdatus Saalik,
- Syeikh Muhammad bin Umar Bakhubairoh yang merupakan pecinta Ahlul Bait. Syeikh Bakhubairoh juga sangat mencintai beliau. Padanya beliau mempelajari Kitab Bidayatul Hidayah karya Imam Al-Ghozali beserta Ijazah dengan sanad yang tersambung Rasulullah Saw.
- Al–Habib Al–‘Arif Billah Abdurrahman bin Ahmad Al–Kaff yang terkenal sangat tawadhu’. Beliau mengaji Kitab Dou’ul Mishbah Syarah Zaitunatul Ilqoh serta sebagian dari Kitab Minhaj dan Kitab Sullamut Taisir. Habib Abdurrahman sangat mencintai beliau dan selalu mengabarkannya tentang hal ini,
- Al–Habib Abu Bakar bin Abdullah Athos Al–Habsyi, di mana beliau mempelajari Kitab Riyadus Sholihin.
- Al–Habib Ahmad bin Alwi Al–Habsyi. Padanya beliau mempelajari Fiqih dan Nahwu, sebagaimana beliau mengaji juga pada Al–Habib Hasan bin Abdullah Asy–Syathiri.
- As–Sayyid Al–Qodhi Muhammad Rosyad Al–Baiti. Padanya beliau mempelajari Kitab Fathul Mu’in (Fiqih), Hasyiyah Al–Kafrowi (Nahwu), Majmu’atul Qodho’ karya Al-Habib Muhsin Bunmi kemudian Kitab ‘Imadur Ridho, Al–Mizan Al–Kubro karya Imam Asy-Sya’roni, Zaitunatul Ilqoh beserta Syarahnya dan Kitab Jawahirul ‘Aqdain.
- Al–Habib Al–Quthb Abdul Qodir bin Ahmad As–Seggaf. Padanya beliau mempelajari Kitab Ihyaul Mayyit Fi Fadhoil Ahlil Bait.
- Syeikh Muhammad Al–‘Abiri Al–Hanbali, seorang Alim besar dalam Madzhab Hanbali. Padanya beliau mengaji Kitab Zadul Mustaqni’ disertai hafalan, kemudian Kitab ‘Uddatul Bahits dalam Ilmu Faroidh hingga Syeikh Al-‘Abiri berkata kepada ” -muridmuridnya : “أفرضكم محمد“ (murid yang paling ahli ilmu faraidh di antara kalian adalah Muhammad).
- Syeikh Abdul Mun’im Tu’ailib, pakar Madzhab Syafi’i. Padanya beliau mempelajari sebagian besar dari Kitab Minhaj begitu juga Tafsir.
Selain guru-guru di atas masih banyak lagi guru-guru beliau yang lain di mana beliau mempelajari Kitab Ar–Roudul Murbi’ dalam Fiqih Hanbali, Syarah Ibn Agil disertai hafalan Alfiyah. Begitu juga Ilmu Ushuluddin, Tafsir, Tajwid, Hadits, Ushul Fiqih, Ilmu ‘Arudh & Qowafi dll.
Bukan hanya di Yaman dan Hijaz saja, beliau juga menuntut ilmu hingga ke Syam, Lebanon, Turki, Mesir, Sudan dan India.
Adapun Guru Spiritual beliau yang merupakan seorang Murobbi dan panutan utama beliau adalah Al–Habib Al–Quthb Ahmad Masyhur bin Thoha Al–Haddad. Di mana segala perilaku dan kepribadian beliau selalu bercermin kepada Habib Ahmad.
Padanya beliau mempelajari Kitab Riyadus Sholihin, Kitab Zadul Muslim Fima Ittafaqo ‘Alaih Al–Bukhri Wa Muslim, Kitab Taisirul Ushul Li Ahaditsir Rosul, Kitab Ihyaul Mayyit Fi Fadhoili Ahlil Bait, kemudian Kitab Al–Jaami’ Ash–Shoghir karya Imam As-Suyuthi, hanya saja beliau belum sempat merampungkannya karena kepulangan Habib ke hadirat Allah SWT. Dahulu beliau selalu menghadiri kajian khusus yang diadakan Habib Ahmad untuk anak-cucunya dengan Kitab Al–Ghoyah Wat Taqrib yang disertai dengan Munaqasyah (diskusi) dalam masalah-masalah fiqih. Dengan Habib Ahmad Masyhur lah beliau mempunyai ikatan yang sangat kuat dan cinta yang begitu mendalam hingga beliau wafat pada tahun 1416 H.